Os programas de residência Médica da UNINOVE, credenciados pela Comissão nacional de residência médica-CNRM, atende plenamente às matrizes de competência propostas para cada especialidade e proporciona aos futuros especialistas formação geral, humanista, reflexiva e ética na sua área de atuação clínica nos campos individual e coletivo, com responsabilidade social e compromisso com a defesa da cidadania e dignidade humana.
Conta com corpo docente e de preceptores altamente qualificados, infraestrutura moderna e proposta pedagógica preconizada pelas respectivas sociedades médicas.
Um dos seus maiores diferenciais são as atividades práticas em equipamentos de saúde que são referência para assistência e ensino no Estado de São Paulo, sempre acompanhados por preceptores. As atividades teórico práticas acontecem nos diversos laboratórios da UNINOVE como no Núcleo Integrado de Simulação UNINOVE (NIS), um verdadeiro hospital simulado, onde é possível treinar situações da realidade profissional em ambiente seguro e controlado, o que possibilita o desenvolvimento de habilidades técnicas e comportamentais, individuais e em equipe.
As atividades teórico práticas também acontecem em unidades parceiras, da rede pública de nível primário, secundário e terciário, com renomado reconhecimento na formação de especialistas médicos.